Багануур дүүрэг дэх Шүүхийн шийдвэр гүйцэтгэх хэлтэс нь Эрх зүйн шинэтгэлийн хүрээнд 2002 онд шинээр батлагдсан хуулийг хэрэгжүүлэхтэй холбогдуулан Шүүхийн шийдвэр гүйцэтгэх ерөнхий газрын даргын 2002 оны 09 дүгээр сарын 05-ны өдрийн А/105 дугаар “Шүүхийн шийдвэр гүйцэтгэх алба” болон өөрчлөгдсөн бөгөөд Цагдаагийн байгууллагын харьяанд байсан Баривчлах, цагдан хорих байрыг хүлээн авч, хорих анги, шийдвэр гүйцэтгэх хэсэг, цагдан хорих байр гэсэн 3 бүтэцтэйгээр хэрэгжүүлж эхэлсэн. Шүүхийн шийдвэр гүйцэтгэх ерөнхий газрын даргын 2013 оны 11 дүгээр сарын 15-ны өдрийн А/201 дүгээр тушаалаар Шийдвэр гүйцэтгэх албанаас салж төсөв, орон тооны бие даасан байдлаар Багануур дүүрэг дэх Шийдвэр гүйцэтгэлийн хэсэг, 2017 оны 10 дугаар сарын 04-ний өдрийн Б/1204 дүгээр тушаалаар Нийслэлийн Шүүхийн шийдвэр гүйцэтгэх газрын харьяа Багануур дүүрэг дэх Шүүхийн шийдвэр гүйцэтгэх тасаг, 2018 оны 07 дугаар сарын 18-ны өдрийн Б/895 дугаар тушаалаар Багануур дүүрэг дэх Шүүхийн шийдвэр гүйцэтгэх хэлтэс-427 дугаар хаалттай хорих ангийн харьяа Шүүхийн шийдвэр гүйцэтгэх хэсэг, 2019 оны 07 дугаар сарын 19-ний өдрийн А/138 дугаарт тушаалаар Шүүхийн шийдвэр гүйцэтгэх ерөнхий газрын Багануур дүүрэг дэх Шүүхийн шийдвэр гүйцэтгэх хэлтэс болон өөрчлөгдөн Иргэний болон Эрүүгийн шийдвэр гүйцэтгэх ажиллагаа, цагдах хорих, таслан сэргийлэх арга хэмжээг холбогдох хууль журмын хүрээнд хэрэгжүүлэн ажиллаж байна.