ЭМНХ-ын Сайдын 1999 оны “Орон нутгийн Эрүүл мэндийн байгууллагуудын талаар авах арга хэмжээний тухай А/187 тоот тушаалын дагуу Аймгийн Засаг даргын 173 тоот захирамж гарч 1999 оны 8-р сарын 20-ны өдрөөс эхлэн аймгийн Эрүүл мэндийн газар /ЭМГ/ байгуулагдсан юм. ЭМГ нь аймгийн Засаг даргын эрхлэх асуудлын хүрээнд хэрэгжүүлэгч агентлаг бөгөөд эрүүл мэндийн асуудлаар Засгийн газар, хариуцсан төрийн захиргааны төв байгууллагаас гаргасан бодлого, шийдвэрийг орон нутгийн түвшинд хэрэгжүүлэх, зохицуулах, хянах чиг үүрэгтэй ажилладаг.