Санхүүгийн хяналт аудитын алба нь Монгол улсын засгийн газрын 2014 оны 327-р тогтоол, аймгийн Засаг даргын 2015 оны 01 дүгээр сарын 20-ны өдрийн Б/12 тоот захирамжаар байгуулагдсан. Албаны дарга-1, Улсын ахлах байцаагч-1, Улсын байцаагч-2, дотоод аудитор-3, жолооч, нярав 1 нийт 8 орон тоотой үйл ажиллагаагаа явуулж байна. Байгууллагын нийт батлагдсан орно тоог 9 байхаар сангийн яамнаас баталсан боловч одоогоор 8 орон тоотойгоор, нягтлан бодогчийн орон тоо дутуу ажиллаж байна. Монгол улсын Засгийн газрын 2021 оны 12 дугаар сарын 14-ний өдрийн 377 дугаар тогтоолоор Санхүүгийн хяналт, аудитын алба нэршлийг Санхүүгийн хяналт, дотоод аудитын алба, Монгол улсын Засгийн газрын 2025 оны 01 дүгээр сарын 29-ний өдрийн 37 дугаар тогтоолоор нэршлийг Санхүүгийн хяналт, дотоод аудитын алба нэршлийг Санхүүгийн хяналт, дотоод аудитын газар болгон өөрчилсөн.